النسخ الخطَّيّة المعتمدة في التحقيق اعتمدنا في تحقيق هذا الكتاب على خمس نسخ خطَّيّة : أربع لكشف الالتباس ، وواحدة للموجز الحاوي ، وكلّ هذه النسخ محفوظة في المكتبة المرعشيّة في مدينة قم المقدّسة : 1 - نسخة برقم 2830 ، مذكورة في فهرس النسخ الخطَّيّة لهذه المكتبة 8 : 36 ، وهي نسخة قديمة ونفيسة جدّا ، كتبت بخط النستعليق في حياة المؤلَّف . يوجد في آخرها خطَّ الشيخ محمّد بن طاهر السماوي بتأريخ 1335 ه‍ ، وفي الورقة الأولى يوجد فيها تملَّك عدد من العلماء ، هم : السيد جعفر بن محمّد بحر العلوم الطباطبائي بتأريخ 1327 ه‍ ، ومحمّد بن طاهر السماوي بتأريخ 1335 ه‍ ، وعلي بن حسن بن حسين بن عيسى الحسيني بتأريخ 13 رجب 1086 ه‍ ، وعبد اللَّه بن صالح البحراني . تقع هذه النسخة في 239 ورقة ، بحجم 20 × 5 / 14 سم ، وكلّ ورقة تحتوي على 22 سطرا ، وقد رمزنا لها بالحرف « ش 1 » . 2 - نسخة برقم 4462 ، مذكورة في فهرس النسخ الخطَّيّة لهذه المكتبة 11 : 49 ، كتبها بخط النسخ علاء الدين بن عبد الرحمن في الرابع من ربيع الآخر سنة 988 ه‍ ، وفي نهايتها عدّة قصائد في مدح الكتاب . تقع هذه النسخة في 215 ورقة ، بحجم 5 / 25 × 17 سم ، وكلّ ورقة تحتوي على 21 سطرا ، وقد رمزنا لها بالحرف « ش 2 » . 3 - نسخة برقم 3693 ، مذكورة في فهرس النسخ الخطَّيّة لهذه المكتبة 10 : 91 ، كتبها محمّد بن عبد العلي الأحسائي البصري في العاشر من شوّال سنة 1066 ه‍ ، وفي الورقة الأولى منها تملَّك علي بن إبراهيم الفتّال .